高分辨率小鼠全脑细胞类型转录组与空间图谱的构建
本研究旨在通过先进的单细胞转录组和空间技术,绘制小鼠全脑细胞类型的图谱。这项研究为了解小鼠大脑的组织结构及其功能提供了重要的理论依据。
一、研究概述
通过单细胞转录组分析(scRNA-seq)及单细胞核转录组分析(snRNA-seq),我们成功鉴定了小鼠大脑的各种细胞类型。结合MERFISH数据集,依据细胞类型及空间位置,将这些细胞分为7个邻域,并进行了详细分析。
二、小鼠大脑神经元的空间分类
神经元细胞类型在小鼠大脑细胞类型中占据主导地位,并具备高度的区域特异性。经过深入分析,我们确认了6个神经元亚群的邻域,其中包括位于大脑皮层、丘脑及下丘脑等多个区域的不同亚群。这些发现为未来针对神经元类型的功能研究提供了重要的空间特征信息。
三、非神经元与未成熟神经元细胞类型的分类
研究中还分类观察了非神经元细胞与未成熟神经元的空间分布特征。例如,室管膜结构的多种亚类显示出不同的空间模式;而特定的细胞类型如VLMC则展现了显著的空间特异性。这些特征表明了不同细胞类型的复杂关系,为后续的生物医学研究提供了潜在的方向。
四、大脑区域特定的细胞类型特征
为了更好地比较细胞类型的转录组相似性及其空间分布的邻近性,我们利用脑组织MERFISH数据集量化了全脑范围内不同细胞亚类的分布模式。结果显示,神经元亚类在特定脑区中高度集中,而非神经元亚类则较为广泛,且与细胞数量的关系并不明显。这一发现对于理解大脑组织结构和功能的复杂性提出了新的看法。
五、结论
综合以上研究,我们通过单细胞联合空间技术绘制了小鼠整个大脑的空间细胞图谱,并系统性分析了神经元及非神经元类型的转录组与空间特异性之间的相关性。这为未来的神经科学研究奠定了基础,特别是在理解不同大脑区域组织中,包括神经元的分布关系及其在生物医学中的应用潜力。通过新葡萄8883官网AMG提供的科技支持,研究团队期待为脑部疾病的治疗开发出新的策略和解决方案。